در حال حاضر بهترین راه بررسی تنوع زیستی و ژنتیكی در گونه ها نژادها جمعیتها لاین ها و سویه ها جانوری مهرداران و بی مهرگان بررسی ماركرهای مولكولی DNA می باشد. ماركر های مولكولی به دلیل دارا بودن ویژگی های: تشخیص آسان افراد هتروزیگوت و هموزیگوت نداشتن اپیستازی توارث كامل تشخیص در كل مراحل حیات عدم محدودیت به ماده بیولوژی دقت بسیار بالا و آسان بودن اندازه گیری آنها بخوبی در جمعیتها قابل استفاده هستند. ماركرهای RAPD میكروستلایت AFLP و SNP از جمله مهمترین ماركرهای مولكولی DNA هستند كه در بررسی ژنوم و در نهایت بررسی تنوع زیستی جانوران استفاده می شوند. به كمك این ماكرها پارامترهای مرتبط با تعیین میزان تنوع از قبیل: فراوانی آللها و ژنوتیپها هتروزیگوسیته تشابه ژنتیكی فاصله ژنتیكی و ... تعیین می گردند. در این مقاله به توضیح مختصر ماهیت این ماركرها پرداخته می شود.
مقدمه با استفاده از انتخاب درونزاد گیری و سیستمهای مختلف آمیزش در دامپروری تقریبا غیر قابل اجتناب است که تنوع ژنتیکی بین نژادها باقی بماند و حتی بعضی از نژادها stiebel eltron ممکن است از بین بروند. بهمین دلیل جامعه علمی نیاز به حفظ ذخایر ژنتیکی را ضروری می داند. در سال 1992 فائو برنامه ای را برای مدیریت جهانی ذخایر ژنتیکی حیوانات اهلی(GMFAG) با هدف شناسایی فعالیتهای اصلاح نژادی و ایجاد یک اطلاعیه جهت مشخص شدن حیوانات در حال انقراض طراحی کرد. این برنامه برای همه گونه های حیوانات اهلی و با استفاده از مارکرهای DNA در نظر گرفته شده است. مارکرهای DNA مثل RAPD میکروستلایت و AFLP در مطالعه تنوع ژنتیکی گاو گوسفند بز طیور خوک و اسبها استفاده شده است. بررسی تنوع ژنتیکی درون و بین جمعیتها از اهمیت ویژه ای برخوردار stiebel eltron است و ممکن است در انتخاب و حفظ ذخایر ژنتیکی نیز مهم باشد. بحث ماركرهای RAPD(Randomly Amplified Polymorphic DNA) ماركر RAPD به ماركرهای تصادفی با تعداد نوكلئوتید كم (حدود هشت تا ده نوكلئوتید) معروفند و در عمل به آسانی قابل استفاده می باشند. این تكنیك متكی بر استفاده از پرایمرهای كوتاه تصادفی در واكنش PCR می باشد می توان به كمك آن با دقت مناسبی stiebel eltron جزئیات و ساختار DNA را برای كشف چند شكلی های قطعات تكثیر شده بین موجودات استفاده نمود. از مزایای مهم این تكنیك نیاز به DNA كم شناسایی چند شكلی در كل ژنوم مقرون به صرفه بودن و تولید قطعات بیشتری از DNA به منظور مشاهده تفاوتهای بیشتر در بین موجودات می باشد. ماركرهای RAPD می توانند در موجودات غیر خویشاوند الگوهای باندی نامشابه تولید كنند و این می تواند برای افرادی كه رابطه نزدیكی با هم دارند نیز وجود داشته باشد. انگشت نگاری كروموزمی از دیگر موارد استفاده از ماركر های RAPD است كه در دیرین شناسی و تشخیص هویت كاربرد stiebel eltron دارد.این ماركر جزء ماركر های غالب می باشد و هتروزیگوتها را شناسایی نمی نماید. از مهمترین معایب این ماركرها حساسیت آنها به شرایط واكنش PCR می باشد (Dodgson et al., 1997). در مقایسه با سایر روشهای مورد بحث این ماركر در رده خوب میانه قرار دارد. ماركرهای میکروستلایت این ماركر متشكل از قطعات كوتاه تكرار شونده stiebel eltron بین یك تا شش جفت بازـتا 60 بارتكرارـ در سطح ژنوم می باشد. هامادا و همكاران در اوایل قرن هجدهم این تكرارها را اثبات كردند (Tautz & Renz, 1984; Smeets et al., 1989, Tautz, 1989). واحدهای تكراری ممكن است از A(n) TG(n) CA(n) و یا AAT(n) تشكیل شده باشند. چندشكلی مورد مطالعه در این ماركر به واسطه تفاوت در تعداد تكرارها stiebel eltron به وجود می آید. دیدن بیش از ده آلل در هر لوكاس غیر عادی نمی باشد و همچنین تا 60% از نمونه می توانند حالت هتروزیگوسیته را نشان دهند (Goldstein & Polack, 1997). از این نوع ماركر در سطح وسیعی در تهیه نقشه كرموزومی انسان موش پرندگان و حیوانات مزرعه استفاده شده است (Goldstein & Pollack, 1997, Taylor et al., 1998, Groenen et al., 2000). از پرایمرهای پیشرفته میكروستلایت می توان در شناسایی گونه های نزدیك به هم استفاده نمود. ماركرهای AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism) stiebel eltron از بهترین stiebel eltron روش های انگشت نگاری DNA استفاده از ماركرهای AFLP می باشد كه بر مبنای استفاده ازآنزیم های برشی DNA و انجام یك PCR انتخابی صورت می گیرد. در روش كار این ماركر به علت تنوع زیادی كه در بین موجودات آشكار می كند از مواد فلورسنس و یكسری از نرم افزارهای تحلیل كننده و عكسهای به دست آمده از باندهای تولیدی بعد از واكنش PCR استفاده می شود. با توجه به نتایج بدست آمده از آن تكنیك مقرون به صرفه stiebel eltron و دارای تكرار پذیری ثبات و قابلیت اطمینان بیشتر نسبت به ماكر RAPD می باشد به همین دلیل بطور وسیعی در تهیه نقشه كروموزومی گیاهان مورد استفاده قرار گرفته است(Vos et al., 1995). به همین صورت در مورد حیوانات مزرعه ای (گاو و مرغ) نیز نتایج درخشانی نشان داده است (Herbergs et al., 1999, Nijman et al., 1999 ). در استفاده از این ماركر باید مراحل انجام كار با دقت و كیفیت بالا صورت گیرد. ماركرهای SNP(Single Nucleotide Polymorphism) stiebel eltron SNP یا چند شكلی جهشهای نقطه ای از روشهایی است كه اخیرا در بررسی تنوع در توالی DNA و شناسایی تنوع بین موجودات مورد استفاده می شود. یك SNP تفاوت یافت شده در یك نوكلئوتید است نسبت به موقعیت مشابه آن در توالی DNA. این ماركر در نواحی كد كننده و غیر كد كننده DNA دیده می شود ( Stoneking, 2001). stiebel eltron در مقایسه توالی DNA دو انسان 6/1 تا2/3 میلیون stiebel eltron SNP دیده شده است. SNP در مناطق كد كننده DNA می تواند به طور مستقیم با فعالیت پروتئین مرتبط باشد و دارای یك الگوی وراثتی ثابت است. در مطالعه بیماری های ژنتیكی و بررسی تنوع در گونه های احشام ترجیح داده می شود از SNP استفاده شود (Heaton, 2000, White et al., 2001). در سومین نشست بین مللی SNP و تحلیل ژنوم گزا
No comments:
Post a Comment